El Departamento de instrumentación de la sede de Ensenada, B. C. tiene como objetivos el diseñar y construir , la instrumentación necesaria que se requiere para la modernización y operación de los telescopios del Instituto de astronomía de la UNAM y de otros Observatorios Astronómicos que lo soliciten.
Principalmente ha contribuido al desarrollo de los nuevos telescopios e instrumentos para el Observatorio Astronómico Nacional de San Pedro Mártir, B.C, donde los instrumentos son sometidos a observaciones astronómicas de alta precisión y calidad científica, soportando climas extremos. Entre los proyectos más recientes se encuentran los siguientes:
- OPTICAM: A Triple-camera Optical System Designed To Explore The Fastest Timescales In Astronomy.(https://www.southampton.ac.uk/opticam/project/index.page)
- Control de la Cúpula del telescopio internacional BOOTES-5.
- Consola de control con precarga electrónica para el telescopio de 84 cm del OAN.
- Cámaras científicas basadas en CCD y CMOS, incluyendo sistemas criogénicos de ciclo cerrado.
- Guiadores excéntricos de los telescopio de 2m, 1.5m y 84 cm del OAN
- El sistema de soporte activo del telescopio de 2 m para la óptica del espejo primario.
- El sistema de ruedas de filtros para los telescopios de 1.5 m y 84 cm (RUCA 2 y Mexman).
- Sistema de subestación eléctrica y sistema de protección contra descargas atmosféricas del telescopio internacional Saint-EX.
Existe un amplio conjunto de tareas adicionales que no son precisamente el desarrollo de un instrumento nuevo, ni se trata simplemente de reparaciones cotidianas, sino que son modificaciones a equipos existentes para optimizarlos, para corregir deficiencias de origen, para modernizarlos o para adaptarlos a otros instrumentos. En este tipo de tareas participa todo el grupo de instrumentación y emplea una cantidad considerable del tiempo del personal. Ejemplos de esto son la actualización de las ruedas de filtros "mexman", las modificaciones a los programas de los fotómetros danés y cuentapulsos, la creación de programas como el "espia", la construcción de monturas para los buscadores de los telescopios y la creación de numerosos programas de apoyo.